植物根系生长监测系统CI-600是全球第一套“土壤原位360度多层次旋转式扫描”获取根系剖面图像的方法，可以扫描监测土壤中活体根系的生长动态。CI-600由旋转式CCD线性扫描头、可埋入土壤中的透明塑料管（根管）、悬挂扫描头的伸缩连杆、数据传输线、笔记本电脑（用户自配）和分析软件组成。测量时将扫描头插入预先埋在土壤中的透明根管中，电脑将控制扫描头自动旋转扫描根管壁上的根系剖面图像。用户可以方便的扫描不同深度的根系图像，以及不同根系（不同根管）的图像。每次扫描都可获得21.56 x 19.56 cm的高分辨率图像，用户可以看到根系（甚至土壤颗粒）的详细结构。利用图像分析软件可以获得的根系剖面图像进行分

CI-600获得的水稻根系图像（）
特性* 非破坏性的原位测量
* 可获取188兆像素高分辨率彩色图像
* 不变形的线性扫描
* 每次扫描可获得21.56 x 19.56 cm的高分辨率图像
* 极便携、易操作、测量快
* 可扫描根系不同层次的图像，合成获得整体根系的剖面图
* 可定点、连续观测根系在整个生长季的动态变化
* USB数据传输，测量、存储方便

技术参数* 扫描头分辨率：最大1200u dpi或188兆像素
* 单图尺寸：21.56 x 19.56 cmu
* 扫描速度：5～15u s（与电脑和扫描分辨率设置有关）
* 电脑接口：USBu
* 供电：电脑USB供电u
* 扫描头尺寸：直径6.4 cm，长34.3u cm
* 根管尺寸：内径6.4 cm，长182.9 cm（长度可定制）u
* 重量：约1 Kgu

这是Northern Arizona University的Dylan Fischer博士的实验结果，从左上到右下为间隔15 cm深度拍摄的6张360度照片，图片的原始尺寸为21.59 x 19.56 cm分析软件WinRHZIO TRON MF 跟踪所感兴趣根系部位，分析如下指标
* 根长
* 平均直径
* 投影面积
* 根表面积
* 根体积
* 根系分类数
* 每种直径分类的根尖数
WinRHZIO Tron MF 是一款功能非常强大的专业根系动态分析软件，可以对CI-600测量结果进行分析，其主要特性如下：
◆ 总根测量(根长、表面积、投影面积、体积、平均直径和数目的提示）
◆ 活动根的名称和它的测量数据（长度，表面积...)
◆ 活动根段的编号和其测量数据（长度，比表面积...)
◆ 可以移动分析区域里单个根或所有根系
◆ 可以改变显示信息的颜色
◆ 可以给图片、根系和片段添加注释
◆ 可以将根管不同深度不同时间的扫描图像连接起来进行整体分析
◆ 文件以ASCII文本格式保存，兼容多数表格程序（如Excel）
时空变化分析
（横轴为时间，不同季节；纵轴为空间，不同深度）

产地:美国CID公司

原位监测法的优点是不干扰根系的生长、根角测量准确、可动态监测、可获得根系在土壤中的原位分布信息等。
代表文献
[1] Dannoura M, Kominami Y, Oguma H, Kanazawa1 Y. The development of an optical scanner method for observation of plant root dynamics. Plant Root 2008;2:14-8. (CI-600)
[2] Graefe S, Hertel D, Leuschner C. Estimating Fine Root Turnover in Tropical Forests along an Elevational Transect using Minirhizotrons. Biotropica 2008:in press. (CI-600)
[3] Fischer DG, Hart SC, LeRoy CJ, Whitham TG. Variation in below-ground carbon fluxes along a Populus hybridization gradient. New Phytologist 2007;176 (2):415-25. (CI-600)
[4] Fischer DG, Hart SC, Rehill BJ, Lindroth RL, Keim P, Whitham TG. Do high-tannin leaves require more roots? . Oecologia 2006;149 (4):668-75. (CI-600)